Сравнительный анализ данных скрининга ингибиторов р73 Е3 лигаз показал ряд очевидных недостатков предложенных соединений-кандидатов. Эффективная концентрация удачных образцов составляет величину порядка 10 µM. Кроме того, следует отметить, что эффективная концентрация ингибитора в случае применения на выделенном белке-рецепторе в три раза превышает концентрацию эффективную в случае клеточной модели. Данный факт свидетельствует о низкой селективности ингибитора по отношению к выбранной мишени, что приводит к появлению дополнительных механизмов индуцирования апоптоза.
Разработана и опробована схема экспериментов, подобранная на основе обзора литературы:
- методика проведения скрининга ингибиторов Е3 лигазы на убиквитиновой модели
- оптимизированная методика выделения и очистки протеасом, которые будут использованы на всех последующих этапах научно-исследовательской работы. Методика выделения протеасом подготовлена с использованием методов клеточной и молекулярной биологии, а также ионной хроматографии.
Проведено создание первичного набора соединений на базе имеющейся в СПбГТИ(ТУ) библиотеке образцов. Критерием отбора служил 2D коэффициент Танимото, определяемый по отношению к заведомо эффективным образцам.